A cultura de fezes é realizada para identificação de microrganismos enteropatogênicos causadores de infecções gastrointestinais, como a gastroenterite. A infecção é caracterizada por diarréia e/ou vômitos e, em alguns casos, febre. A identificação do patógeno causador da gastroenterite pode elucidar melhor a fonte de contaminação e direcionar o tratamento da diarreia, bem como a implantação de medidas preventivas para bloquear a cadeia de transmissão de enteropatógenos.
Na cultura de fezes, habitualmente, são pesquisados os agentes microbianos mais comuns em nosso meio: Salmonella spp., Shigella spp., Escherichia coli Enteropatogênica Clássica (para crianças menores de 2 anos) e Escherichia coli Enteroinvasora.
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